Evolution von Gen-Netzwerken
Viele Merkmale werden nicht ausschließlich durch einzelne Gene reguliert. Das Konzept der Genmodule die aus mehreren funktionell verwandten Genen bestehen, hat sich als nützlich erwiesen. Durch den Vergleich von Geninteraktionen zwischen verschiedenen Arten suchen wir nach Genmodulen, die funktionelle Innovationen und Anpassungen repräsentieren.
Vergleich von Gen-Koexpressionsnetzwerken
In diesem Projekt entwickeln wir eine Pipeline zur Erstellung von Koexpressionsnetzwerken aus öffentlichen Datenbanken und integrieren diese mit phylogenetischen Daten. Darüber hinaus entwickeln wir eine Methode zur Bewertung der Ähnlichkeit zweier Netzwerke, um Geninteraktionen zweier Arten effektiv zu vergleichen. Mit unserem Ansatz wollen wir Gruppen interagierender Gene finden, deren Vorhandensein oder Fehlen mit einem Merkmal korreliert. Dadurch können wir Multigen-Innovationen identifizieren, die mit dem Merkmal verknüpft sind.
